ÆÄÀ̽ãÀ» È°¿ëÇÑ »ý¸íÁ¤º¸ÇÐ 2/e
Ƽ¾Æ±¸ ¾ÈŸ¿À Àú/±èÅÂÀ± ¿ª | ¿¡ÀÌÄÜÃâÆÇ»ç
¡ØÃ¥¼Ò°³
»ý¸íÁ¤º¸ÇÐ µ¥ÀÌÅ͸¦ ÆÄÀ̽ã ÇÁ·Î±×·¡¹Ö ±â¹ý°ú ÇÁ·¹ÀÓ¿öÅ©¸¦ »ç¿ëÇØ Ã³¸®ÇÑ´Ù. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼¿ ºÐ¼®, À¯ÀüüÇÐ, ¸ÞŸÁö³ë¹Í½º(metagenomics), Áý´Ü À¯ÀüÇÐ, °èÅë ¹ß»ýÇÐ, ÇÁ·ÎÅ׿À¹Í½º(proteomics)ÀÇ ³»¿ëÀ» ´Ù·é´Ù. ´Ù¾çÇÑ ÆÄÀ̽㠵µ±¸¿Í ¶óÀ̺귯¸®·Î µ¥ÀÌÅ͸¦ º¯È¯, ºÐ¼®, ½Ã°¢ÈÇÏ´Â ÃֽŠÇÁ·Î±×·¡¹Ö ±â¹ýÀ» ¹è¿î´Ù. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼¿ ºÐ¼® µ¥ÀÌÅÍÀÇ ÇÊÅ͸µ(filtering) ±â¼ú°ú º´·Äó¸® ÇÁ·¹ÀÓ¿öÅ©(framework)ÀÎ ´ë½ºÅ©(Dask)¿Í ½ºÆÄÅ©(Spark)µµ ¼Ò°³ÇÑ´Ù.
¡Ø¸ñÂ÷
1Àå. ÆÄÀ̽ã°ú ÁÖº¯ »ýÅ°è
__¼Ò°³
__¾Æ³ªÄÜ´Ù¸¦ »ç¿ëÇÑ ÇÊ¿ä ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î ¼³Ä¡
__µµÄ¿¸¦ »ç¿ëÇÑ ÇÊ¿ä ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î ¼³Ä¡
__rpy2¸¦ ÅëÇØ R°ú ÀÎÅÍÆäÀ̽º ¸¸µé±â
__ÁÖÇÇÅÍ ³ëÆ®ºÏ¿¡¼ R ¸ÅÁ÷ ¸í·É¾î »ç¿ëÇϱâ
2Àå. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼¿ ºÐ¼®
__¼Ò°³
__NCBI¿Í Áø¹ðÅ© µ¥ÀÌÅͺ£À̽º µÑ·¯º¸±â
__¿°±â¼¿ ºÐ¼®ÀÇ ±âÃÊ
__¹è¿ì±â
__FASTQ ÆÄÀÏ ´Ù·ç±â
__Á¤·Ä µ¥ÀÌÅÍ ´Ù·ç±â
__VCF ÆÄÀÏ µ¥ÀÌÅÍ ºÐ¼®Çϱâ
__°Ô³ð Á¢±Ù¼º°ú SNP µ¥ÀÌÅÍ ÇÊÅÍÇϱâ
__HTSeq·Î NGS µ¥ÀÌÅÍ Ã³¸®Çϱâ
3Àå. °Ô³ð µ¥ÀÌÅÍ ´Ù·ç±â
__¼Ò°³
__ÁÁÀº Ç°ÁúÀÇ ÂüÁ¶ °Ô³ð ´Ù·ç±â...