¸Þµð¾÷

´ëÇк´¿ø Çѹ溴¿ø
Á¾ÇÕº´¿ø ³ëÀκ´¿ø
°Ô½ÃÆÇ
°Ç°­Á¤º¸
º´¿ø¾à±¹Á¤º¸
Èú¸µ½ºÅ丮
Áúº´Á¤º¸
ÀǾàÇ°Á¤º¸
ÀÇÇм­Àû
ÀÓ´ëºÐ¾ç¸Å¸Å
¿¬¼ö°­ÁÂ
±³À°Á¤º¸
¸ÞµðÅå
´ëÇк´¿ø Á¾ÇÕº´¿ø Çѹ溴¿ø Ä¡°úº´¿ø ÇÑÀÇ¿ø ³ëÀÎÀü¹®º´¿ø º¸°Ç¼Ò
¼­¿ï ºÎ»ê ÀÎõ ´ë±¸ ´ëÀü ±¤ÁÖ ¿ï»ê °æ±â °­¿ø ÃæºÏ Ãæ³² °æºÏ °æ³² ÀüºÏ Àü³² Á¦ÁÖ ¼¼Á¾
Ä¡°ú ¾È°ú ÇǺΰú ¼ºÇü¿Ü°ú »êºÎÀΰú ºñ´¢±â°ú ¿Ü°ú ³»°ú Á¤Çü¿Ü°ú À̺ñÀÎÈÄ°ú ¼Ò¾Æ°ú ¾à±¹

¸ñ·Ï ¼öÁ¤ »èÁ¦

ÆÄÀ̽ãÀ» È°¿ëÇÑ »ý¸íÁ¤º¸ÇÐ 2/e

ÃßõÇϱâ
ÀÇÇм­Àû À̹øÁÖ BEST
 

 

ÆÄÀ̽ãÀ» È°¿ëÇÑ »ý¸íÁ¤º¸ÇÐ 2/e  
Ƽ¾Æ±¸ ¾ÈŸ¿À Àú/±èÅÂÀ± ¿ª  | ¿¡ÀÌÄÜÃâÆÇ»ç



¡ØÃ¥¼Ò°³
»ý¸íÁ¤º¸ÇÐ µ¥ÀÌÅ͸¦ ÆÄÀ̽ã ÇÁ·Î±×·¡¹Ö ±â¹ý°ú ÇÁ·¹ÀÓ¿öÅ©¸¦ »ç¿ëÇØ Ã³¸®ÇÑ´Ù. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ ºÐ¼®, À¯ÀüüÇÐ, ¸ÞŸÁö³ë¹Í½º(metagenomics), Áý´Ü À¯ÀüÇÐ, °èÅë ¹ß»ýÇÐ, ÇÁ·ÎÅ׿À¹Í½º(proteomics)ÀÇ ³»¿ëÀ» ´Ù·é´Ù. ´Ù¾çÇÑ ÆÄÀ̽㠵µ±¸¿Í ¶óÀ̺귯¸®·Î µ¥ÀÌÅ͸¦ º¯È¯, ºÐ¼®, ½Ã°¢È­ÇÏ´Â ÃֽŠÇÁ·Î±×·¡¹Ö ±â¹ýÀ» ¹è¿î´Ù. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ ºÐ¼® µ¥ÀÌÅÍÀÇ ÇÊÅ͸µ(filtering) ±â¼ú°ú º´·Äó¸® ÇÁ·¹ÀÓ¿öÅ©(framework)ÀÎ ´ë½ºÅ©(Dask)¿Í ½ºÆÄÅ©(Spark)µµ ¼Ò°³ÇÑ´Ù.


¡Ø¸ñÂ÷
1Àå. ÆÄÀ̽ã°ú ÁÖº¯ »ýÅ°è
__¼Ò°³
__¾Æ³ªÄÜ´Ù¸¦ »ç¿ëÇÑ ÇÊ¿ä ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î ¼³Ä¡
__µµÄ¿¸¦ »ç¿ëÇÑ ÇÊ¿ä ¼ÒÇÁÆ®¿þ¾î ¼³Ä¡
__rpy2¸¦ ÅëÇØ R°ú ÀÎÅÍÆäÀ̽º ¸¸µé±â
__ÁÖÇÇÅÍ ³ëÆ®ºÏ¿¡¼­ R ¸ÅÁ÷ ¸í·É¾î »ç¿ëÇϱâ

2Àå. Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ ºÐ¼®
__¼Ò°³
__NCBI¿Í Áø¹ðÅ© µ¥ÀÌÅͺ£À̽º µÑ·¯º¸±â
__¿°±â¼­¿­ ºÐ¼®ÀÇ ±âÃÊ
__¹è¿ì±â
__FASTQ ÆÄÀÏ ´Ù·ç±â
__Á¤·Ä µ¥ÀÌÅÍ ´Ù·ç±â
__VCF ÆÄÀÏ µ¥ÀÌÅÍ ºÐ¼®Çϱâ
__°Ô³ð Á¢±Ù¼º°ú SNP µ¥ÀÌÅÍ ÇÊÅÍÇϱâ
__HTSeq·Î NGS µ¥ÀÌÅÍ Ã³¸®Çϱâ

3Àå. °Ô³ð µ¥ÀÌÅÍ ´Ù·ç±â
__¼Ò°³
__ÁÁÀº Ç°ÁúÀÇ ÂüÁ¶ °Ô³ð ´Ù·ç±â...

ÆÄ¿ö¸µÅ© ±¤°íµî·Ï
ÀÌ °Ô½Ã¹°À» ÃßõÇÕ´Ï´Ù.
¸Þµð¾÷
" ÆÄÀ̽ãÀ» È°¿ëÇÑ »ý¸íÁ¤º¸ÇÐ 2/e""ÀÇ ÀÌ¿ëÈı⳪ Ãßõ´ñ±ÛÀ» ³²°Ü À¯¿ëÇÑ Á¤º¸·Î °øÀ¯ÇսôÙ. ^^
¡å
ÀÌ °Ô½Ã¹°À» ÃßõÇÕ´Ï´Ù.
 
¸ñ·Ï ¼öÁ¤ »èÁ¦
ÀÌÀü±Û »õ½Ï, ³ª¹° ±×¸®°í º¸Å¸´ÏÄþÆÆ®
´ÙÀ½±Û »ï±¹½Ã´ëÀÇ ²É À̾߱⠿ø¿¹ÇÐÀÚ¿Í ¶°³ª´Â ¿ª»ç ¼Ó ²É ¿©Çà
¹øÈ£
Á¦¸ñ Ãßõ Á¶È¸ µî·ÏÀÏ
13670
[°Ç°­¿¡¼¼ÀÌ] ÇÑÀÇÇÐ ¹Ú»ç°¡ º» ±èÇü¼® ±³¼öÀÇ ¹é..
0 1,420 2021-01-14
13669
[°Ç°­¿¡¼¼ÀÌ] ¾àº¸´Ù´Â ¹ä
0 1,210 2021-01-14
13668
[°Ç°­¿¡¼¼ÀÌ] °ÉÀ» ²¬? Á×À» ¶§ ÈÄȸÇß´Ù!
1 1,293 2021-01-14
13667
[´ÙÀ̾îÆ®/¹Ì¿ë] Àú³á 30ºÐ ´©±¸³ª ´ÙÀ̾îÆ® ÁýÄÛÇصµ..
0 1,305 2021-01-14
13666
[¿ä°¡/üÁ¶] ôÃßÃø¸¸Áõ ºÐ¼® ÇʶóÅ×½º Áöµµ»ç¸¦ ..
0 1,102 2021-01-14
13665
[ÀÇÇÐ/¾àÇÐ] µðÁöÅÐ ÇコÄɾî ÀüÀï ÁøÂ¥Àǻ簡 ¸»..
0 1,257 2021-01-14
13664
[ÀÇÇÐ/¾àÇÐ] µ¹º¸´Â Èû ¾Æ°¡¿Í »ç¿ÍÄÚÀÇ °£º´ ÀÔ..
0 980 2021-01-14
13663
[Áúº´°úÄ¡·á¹ý] ¾ËÄá´ÞÄá ÄáÆÏÀ̾߱â
0 1,036 2021-01-14
13662
[Áúº´°úÄ¡·á¹ý] ´Ã ÇÇ°ïÇÑ ³ª! ¹«¾ùÀÌ ¹®Á¦Àϱî?
0 1,007 2021-01-14
13661
[Áúº´°úÄ¡·á¹ý] ¸é¿ª·ÂÀ» ³ôÀÌ´Â »ýÈ°½À°ü
0 1,000 2021-01-14
13660
[Áúº´°úÄ¡·á¹ý] ÇÏÀ̺긮µå ÀÇÇÐ ¼­¾çÀÇÇÐÀÇ ÇѰ踦 ..
0 1,038 2021-01-14
13659
[ÇÑÀÇÇÐ/ÇѹæÄ¡·á] ¼­È¿¼® ÀÚÀü, ûÆó(ôèøË)
0 1,036 2021-01-14
13658
[»ý¸í°úÇÐ] µ¿¹°°ú ÇÔ²²ÇÏ´Â »î »ç¶÷°ú µ¿¹°ÀÌ ..
0 1,054 2021-01-14
13657
[»ý¸í°úÇÐ] »ý¸íÀ̶õ ¹«¾ùÀΰ¡ 5´Ü°è·Î ÀÌÇØÇÏ´Â..
0 1,113 2021-01-14
13656
[»ý¸í°úÇÐ] Çâ¸ð¸¦ ¶¦À¸¸ç (º¸±ÞÆÇ) Åä¹ÚÀÌ ÁöÇý..
0 1,357 2021-01-14
13655
[»ý¸í°úÇÐ] »ÀÀÇ Çб³ »À¸¦ »ç¶ûÇÏ°Ô µÈ »ç¶÷µé..
0 1,212 2021-01-14
13654
[»ý¸í°úÇÐ] ¹ÙÀÌ·¯½º¿Í Àηù ¹ÙÀÌ·¯½º ½Ã´ë, ¿ì..
0 1,205 2021-01-08
13653
[»ý¸í°úÇÐ] ġŲ¿¡´Â ÁøÈ­ÀÇ ¿ª»ç°¡ ÀÖ´Ù ´ßº²ºÎ..
0 1,251 2021-01-08
13652
[»ý¸í°úÇÐ] ±²ÀåÇÑ °ÍµéÀÇ ¼¼°è °¡Àå Å©°í, °¡Àå..
0 1,203 2021-01-08
13651
[»ý¸í°úÇÐ] ½Ä¹° ¹®´ä ½Ä¹°È­°¡¿Í ³ª´©´Â »ç¼ÒÇÑ..
0 1,289 2021-01-08
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10
 
Ä¿¹Â´ÏƼ
°Ô½ÃÆÇ
°Ç°­Á¤º¸
º´¿ø¾à±¹
Èú¸µ½ºÅ丮
Áúº´Á¤º¸
ÀǾàÇ°Á¤º¸
ÀÇÇм­Àû
ÀÓ´ë¸Å¸Å
¿¬¼ö°­ÁÂ
±³À°Á¤º¸
º´¿øȨÆäÀÌÁö
¸ÞµðÅå
ÇÑÀÇ¿ø
¼ºÇü¿Ü°ú
Ä¡°ú
¾È°ú
¿©¼ºº´¿ø
³»°ú
Á¤Çü¿Ü°ú
ÇǺΰú
¼Ò¾Æ°ú
À̺ñÀÎÈÄ°ú
ºñ´¢ÀÇÇаú
¿ä¾çº´¿ø
ÀçÈ°ÀÇÇаú
µ¿¹°º´¿ø
±âŸº´ÀÇ¿ø
Ãë¾÷°ü·Ã
Áö¿ø¼­¾ç½Ä
¼­·ù¾ç½Ä
¸Þµð¾÷ ¸ð¹ÙÀÏÀ¥
¸Þµð¾÷